把东西全部删掉， 就显示403，目前是在index.php里的header加了404 not found
但是站长平台不认账。

apache主机比较简单, 添加一个解析, apache主机支持无限个域名泛解析:

ServerAdmin abc@ DocumentRoot /home/404
ErrorLog logs/404-error_log
CustomLog logs/404-access_log common

里面添加加粗部分字体即可

DocumentRoot “D:\Web\xx”
ServerName www点xx点com
ServerAlias xx点com
ErrorDocument 404 /

这个要看下你的具体配置：
1.每个二级域名你都手工解析到apache，然后apache手动绑定？
解决方法：在apache的主机配置段里增加这个：ErrorDocument 404 /2. 是不是泛解析？由程序去判断获取的host，返回相应的内容？
这个要看你程序里是如何处理的，看你在里处理了404，应该是ok的

这个要看你的程序的具体情况了，可否说的清楚一些？

如何在服务器上给二级域名，设置404页面。帮你邀请了 @千里狼 回答这个问题，我也正需要。ps：楼主的域名很牛。