一般情况下，我们可能会倾向于扁平化的结构。但我现在的公司网站URL结构却恰恰相反。

如it为business栏目下。

我们网站为：http://www.11111111.com/it/
但出于扁平化的结构应该为：http://www.1111111.com/business/it

两者的好处：扁平化利于用户体验，能简单明了地告知用户自己所在位置，站在SEO的角度，利于权重的分配。
而简短的URL则能让此页面的排名和收录明显提高。

可能我会更倾向于扁平化的结构，站在用户的角度，网站清晰明了，蜘蛛也会更层次分明。但可能我做为站长时间久了更偏向于此，而出于公司利益本身，可能就更喜欢简短的URL吧。

那大家觉得是第一个简短的URL好还是第二个扁平化的URL好？
请说明理由。

首先，扁平化结构的意思你理解错了，你们公司结构刚好是扁平化结构，就是将所有页面都放在网站根目录下，而你所认为的扁平化其实是层级结构，也就树状结构，名词就不解释了。。

如果说哪种好，那么当然是扁平化结构好，蜘蛛更易于抓取，但是扁平化结构不利于网站后期的管理和维护，好在现在搜索引擎对于层级的抓取效率也提高了，只要不是太深，一个普通的网站层级在三层左右都能够被抓取到，如果你们是小企业站，那么可以用扁平化结构，也就是你们公司现在的结构，如果你们网站定位是中大型的，那么还是用树状结构比较好，方便管理。。

以上是属于物理结构的论述，都不是最重要的，关键的一点是链接结构，只要最底层的内容页面从首页不超过3次被点击到都是可以的，也就是说链接离首页越近越好，而层级是越少越好，这样可以方便蜘蛛抓取后处理~~

你理解错扁平化的意思了，扁平化的正确意思是减少url之间的层级关系，让内页到首页的结构距离更近。
所以你网站目前的URL结构就是扁平化的，无需再做修改；
百度搜索引擎对于url的识别抓取技术已经很好，只要不是链接太长，或者存在太多的参数，对于页面的排名收录没有影响，不必太过纠结。

个人觉得还是扁平化的比较好，因为我们做优化的目的就是从客户体验的角度去做的，而不是做给自己看的。
正如楼主所说的：扁平化利于用户体验，能简单明了地告知用户自己所在位置，站在SEO的角度，利于权重的分配。